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.hack//Quantum（ドットハック クワンタム）ストーリー
攻略不可能と言われるイベント「ザワン・シン」
そこに無謀にも挑む３人組のパーティがあった。
双剣士のサクヤ、斬刀士トービアス、そして撃剣士メアリ。
彼女達は迷宮で道に迷い、モンスターに追われている間に冒険者ギルド「八咫鏡」と遭遇する。が、うっかり発動させたトラップにギルドメンバーをはめてしまい大惨劇を引き起こす。翌日、賞金首となってしまった彼女達はタウン内でも付け狙われることに。
逃げ惑うサクヤの前に、ハーミットと名乗る猫型プレイヤーが現れこう尋ねてくるのだった「キミ、あそこで何か変わったもの拾わなかった？」はたしてハーミットの探し物とは！？
（公式サイトより）

.hack//Rootsストーリー西暦2017年、世界最大の大規模オンラインゲームとして栄華を誇る『The World R:2』（ザ ワールド リビジョンツー。以下“The World”）。そのネットワークが放つ力場に引き寄せられた17歳のある高校生は“ハセヲ ”という名のキャラクターを作り、その世界にログインする。しかし、友人から聞いた話と違い、そこはPK行為が認められた殺伐とした雰囲気に満ちていた。ハセヲはすぐにPK行為に遭い、ロスト（ゲーム内での死）してしまう。
ハセヲを蘇生させたのは“オーヴァン”と名乗る見知らぬ男性PC（プレーヤーキャラ）だった。PKに遭った事でこのゲームに不快感を示すハセヲにオーヴァンは『君には“資質”がある』と語る。不可解に感じ、その場を離れるハセヲ。だが、この時からハセヲの前には“The World”での有名プレーヤーが接触してくる様になる。オーヴァンは“The World”内でも特異な存在として知られており、彼らはそんな彼が目を付けたハセヲに何らかの特殊な能力があるのではと考えたのだ。そんな雰囲気を“ウザい”と感じたハセヲは誰も居ないフィールドで一人レベル上げを空しく続ける。そこへ現れるPKキャラ。圧倒的なレベルの差に再びロストの危機に陥ったハセヲを救ったのは、一人の少女キャラ・志乃であった。志乃はオーヴァンが率いるギルド（プレーヤー集団）『黄昏の旅団』のサブリーダー的存在であり、ハセヲを『黄昏の旅団』へと導く為にやって来たと語る。
その後も様々なギルドへの勧誘に戸惑うハセヲだが、最終的には『黄昏の旅団』への入団を選択する。それがどの様な意味を持つのか判らないまま・・・
（「.hack//Roots」wikipediaより）

.hack//SIGNストーリー
物語は『The World』という名のオンラインゲームの仮想現実世界内で繰り広げられる。原因不明のトラブルによってゲームの世界からログアウト（退出）出来なくなった司は、正規には存在しないはずの外見を持つ猫型PC(マハ)との関係、そして謎のモンスター・ガーディアンとの関連を疑われ、プレイヤー有志によって構成される自治団「紅衣の騎士団」より『The World』を崩壊させる危険人物として見なされ、追われることとなる。
司はゲーム内で出会った仲間であるミミルやベア達と協力しながらログアウトの方法、そして『The World』に隠された謎について探索し、その過程で様々な事件に遭遇する。
（「.hack//SIGN」wikipediaより引用）

.hack//Liminalityストーリーゲーム内の出来事と連動して、現実世界にも影響が出てくる。ゲームと現実の境界性(Limitaly)が少しずつ薄くなっていく。その中で日本のCC社（CyberConnect/サイバーコネクト）の”The World”の日本語版ディレクター・徳岡純一郎が、女子高生3人と黒のビト（佐藤一郎）と一緒にゲーム内の謎を現実の世界から解く。
（「.hack//Liminality」wikipediaより引用）